Introdução: Artefatos podem contaminar a análise da variabilidade da frequência cardíaca (VFC). Portanto, a edição dos dados é comumente realizada antes da análise. Objetivos: Avaliar a influência da série temporal (256 intervalos R-R consecutivos ou 5 minutos) e de diferentes filtros automáticos para correção de artefatos na análise da VFC em coortes independentes de pacientes ou adultos saudáveis. Métodos: Estudo observacional. Setenta e quatro participantes foram incluídos: 19 jovens atletas de judô, 14 adultos jovens saudáveis, 17 pacientes com doença de Parkinson, 17 pacientes com acidente vascular cerebral crônico e 10 pacientes submetidos à revascularização do miocárdio. A VFC foi coletada por 10 minutos em repouso por meio de um monitor de frequência cardíaca (Polar V800). Em seguida, o software Kubios foi utilizado para o processamento da VFC, aplicando todos os filtros e considerando 256 intervalos R-R consecutivos ou 5 minutos. Análise Estatística: Os dados foram analisados utilizando o software SigmaPlot for Windows versão 11.0®. Eles foram submetidos aos testes de normalidade e homogeneidade (testes de Shapiro-Wilk e Levene, respectivamente). Para comparar os índices lineares e não lineares da análise da VFC nos diferentes filtros automáticos (nenhum, muito fraco, fraco, médio, forte e muito forte) e séries temporais (5 minutos ou 256 intervalos R-R consecutivos), utilizamos análises de variância para medidas repetidas bidirecionais (two-way ANOVA) com pós-teste de Holm-Sidak. Todas as medições foram expressas como média ± desvio padrão (DP). O nível de significância adotado foi de 5% (p < 0,05). Resultados: Não foram encontradas diferenças significativas na série temporal. Em relação à aplicação de filtros para a correção de artefatos, os índices lineares e não lineares da VFC apresentaram diferença significativa quando comparados entre filtros mais fortes e mais fracos em adultos saudáveis (todos p<0,05). Assim, apenas os filtros extremos tiveram impacto na quantificação da VFC em pacientes com doenças crônicas. Por fim, o grupo CABG não apresentou diferença significativa com a aplicação dos filtros automáticos. Conclusão: Na análise de curto prazo, a série temporal estudada não pareceu influenciar os índices lineares e não lineares da VFC. Por outro lado, os filtros automáticos para correção de artefatos parecem ser capazes de eliminar sinais e promover interpretações errôneas dos índices lineares e não lineares da VFC em coortes de pacientes crônicos e adultos saudáveis.
